A lisozima tem a função de destruir a estrutura da parede celular bacteriana e é uma enzima ferramenta essencial para a fusão celular na engenharia genética e na engenharia celular.
A bromelaína pode decompor as fibras musculares, mas tem um efeito fraco no fibrinogênio.Pode ser usado para digestão medicinal e detumescência anti-inflamatória.
As enzimas proteolíticas animais também desempenham um papel importante em experimentos de pesquisa biológica, degradando proteínas